/[MITgcm]/MITgcm_contrib/high_res_cube/README_ice
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Diff of /MITgcm_contrib/high_res_cube/README_ice

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revision 1.62 by dimitri, Sat Feb 25 16:59:00 2006 UTC revision 1.69 by dimitri, Tue Oct 10 23:27:04 2006 UTC
# Line 1  Line 1 
1  Instructions for setting up a cube-sphere integration with sea-ice.  Instructions for setting up a cube-sphere integration with sea-ice.
2  Date last updated: February 25, 2005  
3  216-CPU code and input used for integrating cube29.  September 28, 2006: 216-CPU code for cube38
4    
5    September 4, 2006
6    Modified 32*32*6*15 experiments to use grid_cs32.* files from
7     verification/tutorial_held_suarez_cs/input instead of
8     tile* files from verification/global_ocean.cs32x15/input
9    
10    August 8, 2006
11    216-CPU code and input used for integrating cube37
12    using "June 10, 2006" MITgcm code.
13    
14    for online T/S profile diagnostics all that is needed is
15      profiles_init_fixed
16      profiles_inloop
17    see pkg/ecco/ecco_cost_init_fixed.F
18        pkg/ecco/cost_averagesfields.F
19    
20    
21  ##########################################################################  ##########################################################################
22  ##########################################################################  ##########################################################################
23  # getting the code from anonymous CVS server  # getting the code from anonymous CVS server
24    #
25    
26      bash or sh shell:
27        $ export CVSROOT=':pserver:cvsanon@mitgcm.org:/u/gcmpack'
28        $ cvs login
29          ( enter the CVS password: "cvsanon" )
30    
31      tcsh or csh shell:
32        $ setenv CVSROOT ':pserver:cvsanon@mitgcm.org:/u/gcmpack'
33        $ cvs login
34          ( enter the CVS password: "cvsanon" )
35    
36  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/README_ice  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/README_ice
37  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods
# Line 13  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/inpu Line 39  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/inpu
39  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/results  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/results
40  cvs co MITgcm_code  cvs co MITgcm_code
41  cvs co MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15  cvs co MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15
42    cvs co MITgcm/verification/tutorial_held_suarez_cs/input
 # remove check in config_check.F  
 > C-TRM     IF ( highOrderVorticity .AND. useCubedSphereExchange ) THEN  
 > C-TRM       WRITE(msgBuf,'(2A)')  
 > C-TRM    &   'CONFIG_CHECK: highOrderVorticity Scheme does not work',  
 > C-TRM    &   ' on CubedSphere grid'  
 > C-TRM       CALL PRINT_ERROR( msgBuf , myThid)  
 > C-TRM       STOP 'ABNORMAL END: S/R CONFIG_CHECK'  
 > C-TRM     ENDIF  
43    
44    
45  ##########################################################################  ##########################################################################
# Line 40  cd .. Line 58  cd ..
58  mkdir run  mkdir run
59  cd run  cd run
60  \rm *  \rm *
61    \cp ../../tutorial_held_suarez_cs/input/grid* .
62  \cp ../input/* .  \cp ../input/* .
63  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .
64  ../build/mitgcmuv >& output.txt  ../build/mitgcmuv >& output.txt
# Line 69  subplot(224), mypcolor(vice(:,:,6)'); co Line 88  subplot(224), mypcolor(vice(:,:,6)'); co
88    
89  ##########################################################################  ##########################################################################
90  ##########################################################################  ##########################################################################
91  # 32*32*6*15, 17-tile, 1-cpu cube sphere experiment  # 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on altix with ifort and pkg/diagnostics
92    # requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau
93    # these can be obained from lou:/u/menemenl/cube
94    
95  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code
96  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .
97  \cp ../code_alt/code.176t_8x4/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s216t_85x85/* .
98    \cp SIZE.h_216 SIZE.h
99    \cp packages.conf_hr packages.conf
100    
101  cd ../build  cd ../build
102  \rm *  \rm *
103  ../../../tools/genmake2 -mods=../code  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of
104    ../../../tools/build_options/linux_ia\
105    64_ifort+mpi_altix_nas
106  make depend  make depend
107  make  make -j
108    
109  cd ..  cd ..
110  mkdir run  mkdir run
111  cd run  cd run
112  \rm *  \rm *
113  \cp ../input/* .  \cp ../input/* .
114  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .
115  ../build/mitgcmuv >& output.txt  ln -sf ../../../../run_template/* .
116    \rm pickup* data.pkg data.seaice data.exf_clim data.exf data bathy_Hmin50.bin
117    \rm *192_94* *cs32* *.m lev* tren* job_c* job_altix150 job_altix92_54t
118    ln -sf ../../../../run_template/pickup.0000000216.cube38 pickup.0000000216
119    ln -sf  ../../../../run_template/pickup_seaice.0000000216.cube38 pickup_seaice.0000000216
120    \cp ../build/mitgcmuv .
121    qsub job_altix
122    
123    
124  ##########################################################################  ##########################################################################
125  ##########################################################################  ##########################################################################
126  # 32*32*6*15, 2-cpu cube sphere on the altices with ifort  # 32*32*6*15, 17-tile, 1-cpu cube sphere experiment
127    
128  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code
129  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .
130  \cp ../../../utils/exch2/code-mods/s12t_16x32/* .  \cp ../code_alt/code.176t_8x4/* .
 \cp SIZE.h_mpi SIZE.h  
   
131  cd ../build  cd ../build
132  \rm *  \rm *
133  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas  ../../../tools/genmake2 -mods=../code
134  make depend  make depend
135  make -j  make
   
136  cd ..  cd ..
137  mkdir run  mkdir run
138  cd run  cd run
139  \rm *  \rm *
140    \cp ../../tutorial_held_suarez_cs/input/grid* .
141  \cp ../input/* .  \cp ../input/* .
142  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .
143  mpirun -np 2 ../build/mitgcmuv  ../build/mitgcmuv >& output.txt
144    
145    
146  ##########################################################################  ##########################################################################
147  ##########################################################################  ##########################################################################
148  # 510*510*6*50, 54-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc  # 32*32*6*15, 2-cpu cube sphere on the altices with ifort
 # starting with pickup file from end of 1992  
 # requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau  
149    
150  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code
151  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .
152  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s54t_170x170/* .  \cp ../../../utils/exch2/code-mods/s12t_16x32/* .
153  \cp packages.conf_hr packages.conf  \cp SIZE.h_mpi SIZE.h
154    
155  cd ../build  cd ../build
156  \rm *  \rm *
157  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_efc+mpi_altix  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas
158  make depend  make depend
159  make -j  make -j
160    
# Line 133  cd .. Line 162  cd ..
162  mkdir run  mkdir run
163  cd run  cd run
164  \rm *  \rm *
165    \cp ../../tutorial_held_suarez_cs/input/grid* .
166  \cp ../input/* .  \cp ../input/* .
167  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .
168  qsub job_altix92_54t  mpirun -np 2 ../build/mitgcmuv
169    
170    
171  ##########################################################################  ##########################################################################
172  ##########################################################################  ##########################################################################
173  # 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on altix with ifort and pkg/diagnostics  # 510*510*6*50, 54-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc
174    # starting with pickup file from end of 1992
175  # requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau  # requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau
 # these can be obained from lou:/u/menemenl/cube  
176    
177  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code
178  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .
179  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s216t_85x85/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s54t_170x170/* .
 \cp SIZE.h_216 SIZE.h  
180  \cp packages.conf_hr packages.conf  \cp packages.conf_hr packages.conf
181    
182  cd ../build  cd ../build
183  \rm *  \rm *
184  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_efc+mpi_altix
185  make depend  make depend
186  make -j  make -j
187    
# Line 162  cd run Line 191  cd run
191  \rm *  \rm *
192  \cp ../input/* .  \cp ../input/* .
193  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .
194  ln -sf ../../../../run_template/* .  qsub job_altix92_54t
 \rm pickup*  
 ln -sf ../../../../run_template/pickup.0000000216.cube27 pickup.0000000216  
 ln -sf  ../../../../run_template/pickup_seaice.0000000216.cube27 pickup_seaice.0000000216  
 \cp ../build/mitgcmuv .  
 qsub job_altix  
195    
196    
197  ##########################################################################  ##########################################################################
# Line 201  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_ Line 225  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_
225  qsub job_altix150  qsub job_altix150
226    
227    
   
   
228  ##########################################################################  ##########################################################################
229  ##########################################################################  ##########################################################################
230  # 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land  # 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land
# Line 235  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_ Line 257  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_
257  job_c20_375cpu < /dev/null >&! output.run &  job_c20_375cpu < /dev/null >&! output.run &
258    
259    
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
260  ##########################################################################  ##########################################################################
261  ##########################################################################  ##########################################################################
262  # 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land  # 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land
# Line 309  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_ Line 321  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_
321  job_c19_500cpu < /dev/null >&! output.run &  job_c19_500cpu < /dev/null >&! output.run &
322    
323    
   
   
   
324  ##########################################################################  ##########################################################################
325  ##########################################################################  ##########################################################################
326  # 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on cosmos  # 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on cosmos
# Line 347  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_ Line 356  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_
356  bsub < job_cosmos  bsub < job_cosmos
357    
358    
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
359  ##########################################################################  ##########################################################################
360  ##########################################################################  ##########################################################################
361  # 510*510*6*50, 216-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc  # 510*510*6*50, 216-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc
Legend:
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changed lines
  Added in v.1.69
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