/[MITgcm]/MITgcm_contrib/high_res_cube/README_ice
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Diff of /MITgcm_contrib/high_res_cube/README_ice

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revision 1.64 by dimitri, Tue Aug 8 13:45:43 2006 UTC revision 1.71 by dimitri, Thu Oct 12 06:09:38 2006 UTC
# Line 1  Line 1 
1  Instructions for setting up a cube-sphere integration with sea-ice.  Instructions for setting up a cube-sphere integration with sea-ice.
2  Date last updated: August 8, 2006  
3    September 28, 2006: 216-CPU code for cube38
4    
5    September 4, 2006
6    Modified 32*32*6*15 experiments to use grid_cs32.* files from
7     verification/tutorial_held_suarez_cs/input instead of
8     tile* files from verification/global_ocean.cs32x15/input
9    
10    August 8, 2006
11  216-CPU code and input used for integrating cube37  216-CPU code and input used for integrating cube37
12  using "June 10, 2006" MITgcm code.  using "June 10, 2006" MITgcm code.
13    
14    for online T/S profile diagnostics all that is needed is
15      profiles_init_fixed
16      profiles_inloop
17    see pkg/ecco/ecco_cost_init_fixed.F
18        pkg/ecco/cost_averagesfields.F
19    
20    
21  ##########################################################################  ##########################################################################
22  ##########################################################################  ##########################################################################
23  # getting the code from anonymous CVS server  # getting the code from anonymous CVS server
24    #
25    
26      bash or sh shell:
27        $ export CVSROOT=':pserver:cvsanon@mitgcm.org:/u/gcmpack'
28        $ cvs login
29          ( enter the CVS password: "cvsanon" )
30    
31      tcsh or csh shell:
32        $ setenv CVSROOT ':pserver:cvsanon@mitgcm.org:/u/gcmpack'
33        $ cvs login
34          ( enter the CVS password: "cvsanon" )
35    
36  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/README_ice  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/README_ice
37  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods
# Line 14  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/inpu Line 39  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/inpu
39  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/results  cvs co MITgcm_contrib/high_res_cube/results
40  cvs co MITgcm_code  cvs co MITgcm_code
41  cvs co MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15  cvs co MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15
42    cvs co MITgcm/verification/tutorial_held_suarez_cs/input
43    
44    
45  ##########################################################################  ##########################################################################
# Line 32  cd .. Line 58  cd ..
58  mkdir run  mkdir run
59  cd run  cd run
60  \rm *  \rm *
61    \cp ../../tutorial_held_suarez_cs/input/grid* .
62  \cp ../input/* .  \cp ../input/* .
63  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .
64  ../build/mitgcmuv >& output.txt  ../build/mitgcmuv >& output.txt
# Line 61  subplot(224), mypcolor(vice(:,:,6)'); co Line 88  subplot(224), mypcolor(vice(:,:,6)'); co
88    
89  ##########################################################################  ##########################################################################
90  ##########################################################################  ##########################################################################
91  # 32*32*6*15, 17-tile, 1-cpu cube sphere experiment  # 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on altix with ifort and pkg/diagnostics
92    # requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau
93    # these can be obained from lou:/u/menemenl/cube
94    
95  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code
96  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .
97  \cp ../code_alt/code.176t_8x4/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s216t_85x85/* .
98    \cp SIZE.h_216 SIZE.h
99    \cp packages.conf_hr packages.conf
100    
101  cd ../build  cd ../build
102  \rm *  \rm *
103  ../../../tools/genmake2 -mods=../code  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas
104  make depend  make depend
105  make  make -j
106    
107  cd ..  cd ..
108  mkdir run  mkdir run
109  cd run  cd run
110  \rm *  \rm *
111  \cp ../input/* .  \cp ../input/* .
112  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .
113  ../build/mitgcmuv >& output.txt  ln -sf ../../../../run_template/* .
114    \rm pickup* data.pkg data.seaice data.exf_clim data.exf data bathy_Hmin50.bin
115    \rm *192_94* *cs32* *.m lev* tren* job_c* job_altix150 job_altix92_54t
116    ln -sf ../../../../run_template/pickup.0000000216.cube38 pickup.0000000216
117    ln -sf  ../../../../run_template/pickup_seaice.0000000216.cube38 pickup_seaice.0000000216
118    \cp ../build/mitgcmuv .
119    qsub job_altix
120    
121    
122  ##########################################################################  ##########################################################################
123  ##########################################################################  ##########################################################################
124  # 32*32*6*15, 2-cpu cube sphere on the altices with ifort  # 32*32*6*15, 17-tile, 1-cpu cube sphere experiment
125    
126  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code
127  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .
128  \cp ../../../utils/exch2/code-mods/s12t_16x32/* .  \cp ../code_alt/code.176t_8x4/* .
 \cp SIZE.h_mpi SIZE.h  
   
129  cd ../build  cd ../build
130  \rm *  \rm *
131  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas  ../../../tools/genmake2 -mods=../code
132  make depend  make depend
133  make -j  make
   
134  cd ..  cd ..
135  mkdir run  mkdir run
136  cd run  cd run
137  \rm *  \rm *
138    \cp ../../tutorial_held_suarez_cs/input/grid* .
139  \cp ../input/* .  \cp ../input/* .
140  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .
141  mpirun -np 2 ../build/mitgcmuv  ../build/mitgcmuv >& output.txt
142    
143    
144  ##########################################################################  ##########################################################################
145  ##########################################################################  ##########################################################################
146  # 510*510*6*50, 54-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc  # 32*32*6*15, 2-cpu cube sphere on the altices with ifort
 # starting with pickup file from end of 1992  
 # requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau  
147    
148  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code
149  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .
150  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s54t_170x170/* .  \cp ../../../utils/exch2/code-mods/s12t_16x32/* .
151  \cp packages.conf_hr packages.conf  \cp SIZE.h_mpi SIZE.h
152    
153  cd ../build  cd ../build
154  \rm *  \rm *
155  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_efc+mpi_altix  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas
156  make depend  make depend
157  make -j  make -j
158    
# Line 125  cd .. Line 160  cd ..
160  mkdir run  mkdir run
161  cd run  cd run
162  \rm *  \rm *
163    \cp ../../tutorial_held_suarez_cs/input/grid* .
164  \cp ../input/* .  \cp ../input/* .
165  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .
166  qsub job_altix92_54t  mpirun -np 2 ../build/mitgcmuv
167    
168    
169  ##########################################################################  ##########################################################################
170  ##########################################################################  ##########################################################################
171  # 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on altix with ifort and pkg/diagnostics  # 510*510*6*50, 54-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc
172    # starting with pickup file from end of 1992
173  # requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau  # requires input files in sudirectories run_template and ncep_rgau
 # these can be obained from lou:/u/menemenl/cube  
174    
175  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code  cd MITgcm/verification/global_ocean.cs32x15/code
176  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/* .
177  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s216t_85x85/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/code-mods/s54t_170x170/* .
 \cp SIZE.h_216 SIZE.h  
178  \cp packages.conf_hr packages.conf  \cp packages.conf_hr packages.conf
179    
180  cd ../build  cd ../build
181  \rm *  \rm *
182  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_ifort+mpi_altix_nas  ../../../tools/genmake2 -mods=../code -of ../../../tools/build_options/linux_ia64_efc+mpi_altix
183  make depend  make depend
184  make -j  make -j
185    
# Line 154  cd run Line 189  cd run
189  \rm *  \rm *
190  \cp ../input/* .  \cp ../input/* .
191  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .  \cp ../../../../MITgcm_contrib/high_res_cube/input/* .
192  ln -sf ../../../../run_template/* .  qsub job_altix92_54t
 \rm pickup* data.pkg data.seaice data.exf_clim data.exf data  
 \rm *192_94* *cs32* *.m lev* tren* job_c* job_altix150 job_altix92_54t  
 ln -sf ../../../../run_template/pickup.0000000216.cube27 pickup.0000000216  
 ln -sf  ../../../../run_template/pickup_seaice.0000000216.cube27 pickup_seaice.0000000216  
 \cp ../build/mitgcmuv .  
 qsub job_altix  
193    
194    
195  ##########################################################################  ##########################################################################
# Line 194  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_ Line 223  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_
223  qsub job_altix150  qsub job_altix150
224    
225    
   
   
226  ##########################################################################  ##########################################################################
227  ##########################################################################  ##########################################################################
228  # 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land  # 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land
# Line 228  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_ Line 255  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_
255  job_c20_375cpu < /dev/null >&! output.run &  job_c20_375cpu < /dev/null >&! output.run &
256    
257    
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
258  ##########################################################################  ##########################################################################
259  ##########################################################################  ##########################################################################
260  # 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land  # 510*510*6*50, 1500-tile, 375-cpu, excludes land
# Line 302  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_ Line 319  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_
319  job_c19_500cpu < /dev/null >&! output.run &  job_c19_500cpu < /dev/null >&! output.run &
320    
321    
   
   
   
322  ##########################################################################  ##########################################################################
323  ##########################################################################  ##########################################################################
324  # 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on cosmos  # 510*510*6*50, 216-cpu cube sphere on cosmos
# Line 340  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_ Line 354  ln -sf  ../../../../run_template/pickup_
354  bsub < job_cosmos  bsub < job_cosmos
355    
356    
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
   
357  ##########################################################################  ##########################################################################
358  ##########################################################################  ##########################################################################
359  # 510*510*6*50, 216-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc  # 510*510*6*50, 216-tile, 54-cpu cube sphere on the altices with efc
Legend:
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changed lines
  Added in v.1.71
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